接通電源后，可以通過串行接口對Seagate驅動器執行一系列指令。由于指令很多，所以采取了將指令按“Levels”分類的方法。甚至，可以通過串行接口按位讀或寫，而且讀、寫、查找和錯誤日志操作等命令在很多“Levels”都是有效的。診斷指令用來代替AT腳本進行測試。當運行診斷指令時，會有一些信息指示當前正在進行的測試和測試的狀態。

固件包括flash ROM中的代碼和多個模塊文件。flash ROM代碼包括一個工廠代碼和一個用戶代碼。工廠代碼包括所有的串行檢測命令，但不包括AT接口命令。用戶代碼包括所有的AT接口命令，和少量的串行端口檢測命令。

下面是串行端口支持的指令列表：

Level T-Cert測試，包括：
                 下載代碼；
                 開始工廠測試；
                 設置驅動器“Age”；
                 讀Cert測試日志，讀出錯日志，寫測試數據到flash，等命令。

Level 1-存儲器控制命令，包括：
                 顯示緩沖，顯示存儲器，設置存儲器，將緩沖內容拷貝到flsah，從磁盤讀取sysvars等命令。

Level 2 -驅動器命令，包括：
               測試柱面，測試磁頭，任意配置柱面/磁頭和數據工作方式等的命令；
設置數據工作方式，執行ECC測試，操作出錯日志，轉儲RAM等的命令；
將物理參數轉換為邏輯參數，隱藏或啟用柱面/磁頭等的命令；
主軸起轉，主軸停轉，尋址，讀，寫，讀long，寫long，讀比較，睡眠，設置retry等的命令。

Level 3 - 尋址命令，包括：
 顯示 zone 表；
 馬達加速度測試；
 測量磁頭切換 & 定位時間；
 顯示磁頭偏移；
 傳動臂開環測試
 尋址，物理尋址，不同長度尋址測試；
 臂鎖測試
 顯示傳動臂位置；
 遲滯測試；
 臂鎖試驗程序測試

Level 4 - 伺服尋道命令，包括：
 操作隱藏柱面表；
 尋道誤差測試；
 顯示位置誤差測試；
 Zap 伺服脈沖；
 設置伺服偏移；
 設置/顯示尋道增益
 向傳動臂發送脈沖
Level 5 -  僅在工廠中使用
Level 6 - 批處理命令

Level 7 -校正命令，包括：
顯示和調整參數；
讀磁道診斷；
AGC（自動增益控制）；
對所有zones執行VCO校正。

Level 8 - 特殊群寫命令，保括
 - 伺服診斷子命令；
 - 配置命令；
 - 外部鎖定主軸,  主軸轉速調整；
 - 設置馬達偏流。

Level 9 - 驅動器命令(完全忽略缺陷管理模式)

除了上面9個level 的命令以外，還有兩組附加的命令：在線命令和通用命令。在線命令是用來顯示狀態的；普通命令用來“poker（存入）”和“peek（讀取）”存儲器，存取寄存器，緩沖存儲器和數據存儲器。